
安捷倫生物分析儀實現(xiàn)核酸蛋白樣品質量精準控制
內容簡介:
本文詳細探討安捷倫4200 TapeStation系統(tǒng)在生物樣品質量控制中的技術優(yōu)勢。系統(tǒng)分析其電泳分離原理、微流體芯片設計和智能化數(shù)據(jù)分析算法,闡述其在基因組學、轉錄組學研究中對DNA、RNA樣品質量評估的重要價值。
正文:
下一代測序技術的快速發(fā)展對樣品質量提出了更高要求。安捷倫4200 TapeStation系統(tǒng)通過自動化電泳分析,為核酸和蛋白樣品質量提供了快速、準確、可重復的評估方案。
該系統(tǒng)采用 微流體芯片技術,每個芯片包含16個獨立樣品孔道,孔徑精確控制在50μm,確保分離重現(xiàn)性。電泳分離在約55℃條件下進行,使用取代型熒光染料,靈敏度達0.5 ng/μL,動態(tài)范圍跨越3個數(shù)量級(5-5000 pg/μL)。
在DNA分析方面,系統(tǒng)提供基因組DNA ScreenTape檢測方案,可準確評估DNA完整性(DIN值),區(qū)分降解和完整DNA。研究表明,DIN值>7的樣品在WGS測序中可獲得>95%的mapping rate,而DIN值<8的樣品n50值下降50%。在rna分析中,rna完整性數(shù)值(rin)與測序數(shù)據(jù)質量高度相關,rin值>8的樣品在RNA-Seq中可檢測到多20%的低表達基因。
智能化數(shù)據(jù)分析是另一大亮點。系統(tǒng)自動計算濃度、完整性指標,并提供凝膠狀圖像和電泳圖譜。算法采用機器學習技術,可識別常見降解模式(如5'端降解、隨機降解等),給出樣品質量預警。檢測時間僅需1-2分鐘/樣品,比傳統(tǒng)瓊脂糖電泳效率提高10倍。
應用數(shù)據(jù)顯示,在大型基因組計劃中,該系統(tǒng)成功對超過10萬個樣品進行質量篩選,淘汰率15%,顯著提高了測序數(shù)據(jù)質量。在單細胞測序中,可準確評估微量樣品(100 pg)質量,為單細胞研究提供了可靠的質量控制方案。
關鍵詞: 生物分析儀、樣品質量控制、DNA完整性、RNA完整性、下一代測序